El Parque Natural se encuentra aproximadamente en el centro geográfico de Extremadura, sobre las Vegas del Guadiana. Puede considerarse el vértice de dos formaciones montañosas que confluyen en este peculiar enclave. Por un lado, las alineaciones montañosas de Sierra de San Pedro y por otro, las Sierras de Montánchez, prolongación del gran macizo de Villuercas, siedo la última barrera montañosa antes de cruzar el valle del Guadiana.

En sus más de 10.500 ha. de superficie, están incluidos parcialmente los términos municipales de Mérida, Aljucén, Mirandilla, San Pedro de Mérida y Guareña. La localidad de Trujillanos, pese a ser la tradicional entrada al Parque, no se incluye dentro de sus límites, pero acoge el Centro de Interpretación ubicado en la Dehesa Boyal de Trujillanos, justo al inicio de la carretera que parte hacia el Embalse de Cornalvo y al lado de la Ermita de San Isidro. El diseño exterior del edificio está inspirado en los cortijos típicos de la zona, incorporando una vetusta encina en su patio interior.